首先PFA和PTFE的性能有所不同：PFA的熔融粘結性增強，熔體的粘度會下降，性能和PTFE相比來說沒有變化，PFA樹脂可以通過普通熱塑性成型的加工方法來進行加工。

PTFE能耐王水和其他有機溶劑、耐氣候，是氟塑料中比較優秀的耐老化性質，具有固體材料中較小的表面張力并且不會粘附任何的物質，無毒、良好的電器性能，是理想的C級絕緣的材料。

PFA和PTFE的用途也有所不同，PFA比較適用于制作耐腐蝕件、密封件、絕緣件、高溫電線、電纜的絕緣層、防腐設備、密封材料、化學容器、半導體制造設備等，PTFE則適用于化工、石油、電氣電子、機械工業、膜類產品等行業都有著廣泛的應用。